Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT71Q3SY84 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT71Q3SY84 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT71Q3SY84 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT71Q3SY84 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT71Q3SY84 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms