Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNW1

SNAI3, Zinc finger protein SNAI3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3Q3KNW1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNAI3Q3KNW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAI3Q3KNW1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAI3Q3KNW1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms