Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LETM2Q2VYF4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LETM2Q2VYF4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LETM2Q2VYF4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LETM2Q2VYF4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LETM2Q2VYF4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LETM2Q2VYF4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LETM2Q2VYF4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LETM2Q2VYF4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LETM2Q2VYF4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LETM2Q2VYF4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LETM2Q2VYF4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LETM2Q2VYF4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms