Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM71Q2Q1W2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM71Q2Q1W2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM71Q2Q1W2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM71Q2Q1W2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM71Q2Q1W2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM71Q2Q1W2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms