Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPPQ16740 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPPQ16740 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPPQ16740 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLPPQ16740 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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