Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NTRK2Q16620 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK2Q16620 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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