Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTF1Q16619 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTF1Q16619 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTF1Q16619 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms