Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MED1Q15648 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MED1Q15648 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MED1Q15648 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MED1Q15648 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MED1Q15648 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MED1Q15648 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MED1Q15648 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MED1Q15648 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MED1Q15648 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MED1Q15648 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MED1Q15648 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MED1Q15648 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MED1Q15648 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MED1Q15648 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MED1Q15648 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MED1Q15648 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MED1Q15648 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MED1Q15648 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MED1Q15648 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MED1Q15648 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
MED1Q15648 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MED1Q15648 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MED1Q15648 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
MED1Q15648 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MED1Q15648 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MED1Q15648 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MED1Q15648 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MED1Q15648 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MED1Q15648 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
MED1Q15648 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
MED1Q15648 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MED1Q15648 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MED1Q15648 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MED1Q15648 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MED1Q15648 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MED1Q15648 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
MED1Q15648 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MED1Q15648 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MED1Q15648 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MED1Q15648 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MED1Q15648 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
MED1Q15648 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MED1Q15648 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
MED1Q15648 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MED1Q15648 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MED1Q15648 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MED1Q15648 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MED1Q15648 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MED1Q15648 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MED1Q15648 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MED1Q15648 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MED1Q15648 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MED1Q15648 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
MED1Q15648 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MED1Q15648 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MED1Q15648 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MED1Q15648 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
MED1Q15648 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MED1Q15648 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MED1Q15648 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MED1Q15648 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MED1Q15648 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MED1Q15648 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MED1Q15648 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
MED1Q15648 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MED1Q15648 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MED1Q15648 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MED1Q15648 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MED1Q15648 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MED1Q15648 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MED1Q15648 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MED1Q15648 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MED1Q15648 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MED1Q15648 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MED1Q15648 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
MED1Q15648 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MED1Q15648 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MED1Q15648 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MED1Q15648 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MED1Q15648 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
MED1Q15648 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
MED1Q15648 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
MED1Q15648 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
MED1Q15648 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MED1Q15648 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
MED1Q15648 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
MED1Q15648 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
MED1Q15648 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
MED1Q15648 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
MED1Q15648 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
MED1Q15648 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
MED1Q15648 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
MED1Q15648 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MED1Q15648 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MED1Q15648 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MED1Q15648 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MED1Q15648 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MED1Q15648 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MED1Q15648 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms