Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP5Q15291 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP5Q15291 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP5Q15291 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBBP5Q15291 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms