Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SQLEQ14534 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SQLEQ14534 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SQLEQ14534 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SQLEQ14534 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SQLEQ14534 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SQLEQ14534 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SQLEQ14534 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SQLEQ14534 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SQLEQ14534 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SQLEQ14534 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SQLEQ14534 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
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