Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CDK13Q14004 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CDK13Q14004 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
CDK13Q14004 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CDK13Q14004 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CDK13Q14004 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CDK13Q14004 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
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