Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTMR3Q13615 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR3Q13615 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTMR3Q13615 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MTMR3Q13615 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
MTMR3Q13615 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTMR3Q13615 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTMR3Q13615 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTMR3Q13615 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MTMR3Q13615 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTMR3Q13615 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTMR3Q13615 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MTMR3Q13615 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MTMR3Q13615 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTMR3Q13615 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MTMR3Q13615 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTMR3Q13615 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MTMR3Q13615 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTMR3Q13615 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTMR3Q13615 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTMR3Q13615 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTMR3Q13615 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTMR3Q13615 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTMR3Q13615 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTMR3Q13615 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MTMR3Q13615 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTMR3Q13615 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
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