Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms