Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SPP2Q13103 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SPP2Q13103 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPP2Q13103 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPP2Q13103 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPP2Q13103 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SPP2Q13103 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
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