Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANK3Q12955 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANK3Q12955 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANK3Q12955 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANK3Q12955 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANK3Q12955 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANK3Q12955 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANK3Q12955 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ANK3Q12955 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANK3Q12955 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANK3Q12955 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANK3Q12955 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANK3Q12955 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANK3Q12955 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANK3Q12955 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANK3Q12955 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANK3Q12955 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ANK3Q12955 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms