Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
APOBRQ0VD83 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBRQ0VD83 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOBRQ0VD83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
APOBRQ0VD83 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOBRQ0VD83 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms