Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXL1Q08397 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL1Q08397 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL1Q08397 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL1Q08397 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL1Q08397 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL1Q08397 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL1Q08397 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL1Q08397 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL1Q08397 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL1Q08397 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LOXL1Q08397 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL1Q08397 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL1Q08397 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL1Q08397 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LOXL1Q08397 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL1Q08397 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL1Q08397 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL1Q08397 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LOXL1Q08397 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL1Q08397 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms