Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK18Q07002 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK18Q07002 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK18Q07002 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms