Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB3Q04118 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRB3Q04118 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRB3Q04118 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms