Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL6Q02878 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL6Q02878 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPL6Q02878 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL6Q02878 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL6Q02878 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms