Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRPAP78324 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIRPAP78324 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPAP78324 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms