Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P63132 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P63132 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P63132 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms