Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VBP1P61758 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VBP1P61758 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VBP1P61758 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VBP1P61758 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VBP1P61758 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VBP1P61758 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VBP1P61758 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VBP1P61758 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VBP1P61758 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VBP1P61758 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VBP1P61758 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VBP1P61758 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VBP1P61758 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VBP1P61758 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VBP1P61758 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VBP1P61758 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VBP1P61758 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VBP1P61758 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VBP1P61758 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VBP1P61758 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VBP1P61758 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VBP1P61758 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VBP1P61758 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VBP1P61758 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VBP1P61758 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VBP1P61758 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VBP1P61758 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VBP1P61758 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VBP1P61758 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VBP1P61758 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VBP1P61758 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VBP1P61758 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VBP1P61758 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VBP1P61758 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VBP1P61758 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VBP1P61758 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VBP1P61758 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VBP1P61758 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VBP1P61758 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VBP1P61758 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VBP1P61758 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VBP1P61758 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VBP1P61758 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VBP1P61758 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VBP1P61758 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VBP1P61758 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VBP1P61758 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VBP1P61758 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VBP1P61758 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VBP1P61758 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VBP1P61758 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VBP1P61758 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VBP1P61758 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VBP1P61758 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VBP1P61758 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VBP1P61758 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VBP1P61758 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VBP1P61758 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VBP1P61758 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VBP1P61758 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VBP1P61758 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VBP1P61758 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VBP1P61758 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VBP1P61758 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VBP1P61758 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VBP1P61758 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VBP1P61758 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VBP1P61758 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VBP1P61758 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VBP1P61758 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VBP1P61758 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VBP1P61758 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VBP1P61758 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VBP1P61758 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VBP1P61758 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VBP1P61758 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VBP1P61758 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VBP1P61758 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VBP1P61758 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VBP1P61758 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VBP1P61758 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VBP1P61758 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VBP1P61758 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VBP1P61758 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VBP1P61758 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VBP1P61758 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VBP1P61758 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VBP1P61758 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VBP1P61758 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VBP1P61758 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VBP1P61758 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VBP1P61758 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VBP1P61758 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VBP1P61758 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VBP1P61758 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VBP1P61758 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VBP1P61758 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VBP1P61758 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VBP1P61758 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms