Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEFA3P59666 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DEFA3P59666 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEFA3P59666 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms