Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTP1P59025 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTP1P59025 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTP1P59025 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTP1P59025 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTP1P59025 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTP1P59025 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTP1P59025 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTP1P59025 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTP1P59025 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTP1P59025 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTP1P59025 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RTP1P59025 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTP1P59025 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTP1P59025 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTP1P59025 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTP1P59025 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTP1P59025 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RTP1P59025 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTP1P59025 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTP1P59025 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTP1P59025 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
RTP1P59025 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTP1P59025 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTP1P59025 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTP1P59025 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTP1P59025 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTP1P59025 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTP1P59025 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTP1P59025 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTP1P59025 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTP1P59025 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTP1P59025 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTP1P59025 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTP1P59025 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RTP1P59025 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTP1P59025 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTP1P59025 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTP1P59025 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTP1P59025 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTP1P59025 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTP1P59025 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTP1P59025 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTP1P59025 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTP1P59025 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTP1P59025 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTP1P59025 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTP1P59025 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTP1P59025 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTP1P59025 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTP1P59025 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTP1P59025 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RTP1P59025 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTP1P59025 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTP1P59025 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RTP1P59025 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTP1P59025 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTP1P59025 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTP1P59025 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTP1P59025 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTP1P59025 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTP1P59025 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTP1P59025 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTP1P59025 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTP1P59025 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RTP1P59025 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTP1P59025 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RTP1P59025 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RTP1P59025 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTP1P59025 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTP1P59025 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RTP1P59025 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RTP1P59025 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTP1P59025 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTP1P59025 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTP1P59025 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTP1P59025 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTP1P59025 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTP1P59025 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTP1P59025 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTP1P59025 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTP1P59025 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RTP1P59025 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTP1P59025 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTP1P59025 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTP1P59025 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTP1P59025 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTP1P59025 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTP1P59025 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTP1P59025 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTP1P59025 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTP1P59025 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RTP1P59025 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTP1P59025 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTP1P59025 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTP1P59025 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTP1P59025 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTP1P59025 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTP1P59025 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTP1P59025 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms