Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RWDD2BP57060 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RWDD2BP57060 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RWDD2BP57060 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RWDD2BP57060 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms