Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELLP55199 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELLP55199 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELLP55199 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELLP55199 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELLP55199 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELLP55199 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELLP55199 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELLP55199 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELLP55199 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELLP55199 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ELLP55199 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELLP55199 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELLP55199 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELLP55199 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELLP55199 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELLP55199 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELLP55199 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELLP55199 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELLP55199 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELLP55199 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELLP55199 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELLP55199 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELLP55199 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELLP55199 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELLP55199 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELLP55199 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELLP55199 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELLP55199 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELLP55199 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELLP55199 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELLP55199 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELLP55199 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELLP55199 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELLP55199 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELLP55199 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELLP55199 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ELLP55199 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELLP55199 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELLP55199 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELLP55199 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELLP55199 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELLP55199 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELLP55199 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELLP55199 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELLP55199 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELLP55199 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELLP55199 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELLP55199 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELLP55199 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELLP55199 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELLP55199 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELLP55199 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELLP55199 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELLP55199 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELLP55199 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELLP55199 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELLP55199 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELLP55199 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELLP55199 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELLP55199 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELLP55199 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELLP55199 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELLP55199 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELLP55199 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELLP55199 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELLP55199 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELLP55199 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELLP55199 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELLP55199 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELLP55199 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELLP55199 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELLP55199 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ELLP55199 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELLP55199 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELLP55199 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELLP55199 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELLP55199 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELLP55199 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELLP55199 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELLP55199 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELLP55199 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELLP55199 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELLP55199 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELLP55199 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELLP55199 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELLP55199 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELLP55199 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELLP55199 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELLP55199 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELLP55199 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELLP55199 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELLP55199 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELLP55199 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELLP55199 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELLP55199 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELLP55199 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ELLP55199 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELLP55199 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELLP55199 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms