Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRADP55042 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRADP55042 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRADP55042 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRADP55042 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRADP55042 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRADP55042 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRADP55042 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRADP55042 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRADP55042 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRADP55042 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRADP55042 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRADP55042 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRADP55042 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRADP55042 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRADP55042 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRADP55042 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRADP55042 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRADP55042 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRADP55042 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRADP55042 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRADP55042 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRADP55042 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRADP55042 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRADP55042 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRADP55042 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRADP55042 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRADP55042 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRADP55042 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRADP55042 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRADP55042 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRADP55042 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRADP55042 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRADP55042 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRADP55042 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRADP55042 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRADP55042 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRADP55042 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRADP55042 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRADP55042 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRADP55042 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRADP55042 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRADP55042 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRADP55042 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRADP55042 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRADP55042 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRADP55042 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RRADP55042 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRADP55042 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRADP55042 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRADP55042 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRADP55042 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRADP55042 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRADP55042 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRADP55042 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRADP55042 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRADP55042 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRADP55042 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRADP55042 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRADP55042 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRADP55042 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRADP55042 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RRADP55042 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRADP55042 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRADP55042 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRADP55042 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRADP55042 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRADP55042 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRADP55042 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRADP55042 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRADP55042 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRADP55042 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRADP55042 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRADP55042 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRADP55042 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRADP55042 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRADP55042 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRADP55042 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRADP55042 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRADP55042 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRADP55042 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRADP55042 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRADP55042 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRADP55042 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRADP55042 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRADP55042 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRADP55042 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRADP55042 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRADP55042 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRADP55042 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRADP55042 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRADP55042 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRADP55042 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRADP55042 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRADP55042 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRADP55042 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRADP55042 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRADP55042 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRADP55042 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRADP55042 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms