Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD4P55036 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD4P55036 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms