Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB1P54762 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB1P54762 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB1P54762 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB1P54762 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms