Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAP1GDS1P52306 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAP1GDS1P52306 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAP1GDS1P52306 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms