Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX5P50542 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX5P50542 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX5P50542 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX5P50542 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PEX5P50542 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX5P50542 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX5P50542 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX5P50542 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX5P50542 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX5P50542 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEX5P50542 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEX5P50542 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX5P50542 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX5P50542 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX5P50542 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX5P50542 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX5P50542 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX5P50542 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX5P50542 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PEX5P50542 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEX5P50542 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX5P50542 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX5P50542 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX5P50542 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX5P50542 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX5P50542 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX5P50542 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX5P50542 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX5P50542 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX5P50542 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX5P50542 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX5P50542 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX5P50542 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX5P50542 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX5P50542 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX5P50542 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX5P50542 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX5P50542 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX5P50542 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX5P50542 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX5P50542 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX5P50542 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX5P50542 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX5P50542 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX5P50542 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX5P50542 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX5P50542 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX5P50542 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX5P50542 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX5P50542 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX5P50542 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX5P50542 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX5P50542 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX5P50542 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX5P50542 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX5P50542 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX5P50542 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX5P50542 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX5P50542 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX5P50542 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX5P50542 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX5P50542 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX5P50542 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX5P50542 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX5P50542 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX5P50542 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX5P50542 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX5P50542 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX5P50542 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX5P50542 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PEX5P50542 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX5P50542 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX5P50542 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX5P50542 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX5P50542 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX5P50542 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX5P50542 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX5P50542 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX5P50542 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX5P50542 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PEX5P50542 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PEX5P50542 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX5P50542 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX5P50542 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX5P50542 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX5P50542 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX5P50542 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX5P50542 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX5P50542 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX5P50542 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX5P50542 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX5P50542 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PEX5P50542 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PEX5P50542 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PEX5P50542 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PEX5P50542 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX5P50542 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX5P50542 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX5P50542 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms