Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT6CP48668 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT6CP48668 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT6CP48668 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms