Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
REG1BP48304 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
REG1BP48304 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
REG1BP48304 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
REG1BP48304 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
REG1BP48304 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
REG1BP48304 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
REG1BP48304 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
REG1BP48304 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
REG1BP48304 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
REG1BP48304 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
REG1BP48304 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
REG1BP48304 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
REG1BP48304 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REG1BP48304 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REG1BP48304 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REG1BP48304 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REG1BP48304 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REG1BP48304 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REG1BP48304 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REG1BP48304 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
REG1BP48304 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REG1BP48304 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
REG1BP48304 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
REG1BP48304 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REG1BP48304 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
REG1BP48304 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REG1BP48304 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REG1BP48304 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
REG1BP48304 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REG1BP48304 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
REG1BP48304 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REG1BP48304 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REG1BP48304 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
REG1BP48304 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REG1BP48304 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REG1BP48304 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
REG1BP48304 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
REG1BP48304 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REG1BP48304 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
REG1BP48304 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REG1BP48304 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REG1BP48304 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REG1BP48304 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REG1BP48304 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REG1BP48304 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REG1BP48304 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REG1BP48304 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
REG1BP48304 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REG1BP48304 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REG1BP48304 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REG1BP48304 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REG1BP48304 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REG1BP48304 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REG1BP48304 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REG1BP48304 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REG1BP48304 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REG1BP48304 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REG1BP48304 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REG1BP48304 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REG1BP48304 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REG1BP48304 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REG1BP48304 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REG1BP48304 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REG1BP48304 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REG1BP48304 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REG1BP48304 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
REG1BP48304 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REG1BP48304 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REG1BP48304 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REG1BP48304 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REG1BP48304 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REG1BP48304 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
REG1BP48304 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
REG1BP48304 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
REG1BP48304 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
REG1BP48304 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
REG1BP48304 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
REG1BP48304 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
REG1BP48304 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
REG1BP48304 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
REG1BP48304 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
REG1BP48304 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
REG1BP48304 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
REG1BP48304 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
REG1BP48304 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
REG1BP48304 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
REG1BP48304 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
REG1BP48304 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
REG1BP48304 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
REG1BP48304 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
REG1BP48304 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
REG1BP48304 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
REG1BP48304 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
REG1BP48304 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
REG1BP48304 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
REG1BP48304 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
REG1BP48304 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
REG1BP48304 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
REG1BP48304 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.2 ms