Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN7P41732 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN7P41732 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN7P41732 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN7P41732 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms