Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC1P41238 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC1P41238 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms