Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPGP40121 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPGP40121 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPGP40121 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPGP40121 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPGP40121 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPGP40121 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPGP40121 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPGP40121 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPGP40121 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPGP40121 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPGP40121 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPGP40121 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPGP40121 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPGP40121 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPGP40121 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPGP40121 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPGP40121 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPGP40121 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPGP40121 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPGP40121 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPGP40121 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPGP40121 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPGP40121 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPGP40121 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPGP40121 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPGP40121 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPGP40121 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPGP40121 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPGP40121 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPGP40121 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPGP40121 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPGP40121 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPGP40121 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPGP40121 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPGP40121 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPGP40121 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPGP40121 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPGP40121 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPGP40121 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPGP40121 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPGP40121 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPGP40121 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPGP40121 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPGP40121 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPGP40121 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPGP40121 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPGP40121 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPGP40121 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPGP40121 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPGP40121 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPGP40121 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPGP40121 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPGP40121 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPGP40121 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPGP40121 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPGP40121 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPGP40121 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPGP40121 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPGP40121 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPGP40121 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPGP40121 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPGP40121 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPGP40121 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPGP40121 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPGP40121 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPGP40121 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPGP40121 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPGP40121 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPGP40121 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPGP40121 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPGP40121 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPGP40121 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPGP40121 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPGP40121 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPGP40121 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPGP40121 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPGP40121 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPGP40121 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPGP40121 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPGP40121 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPGP40121 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPGP40121 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPGP40121 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPGP40121 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPGP40121 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPGP40121 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPGP40121 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPGP40121 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPGP40121 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPGP40121 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPGP40121 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPGP40121 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPGP40121 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPGP40121 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPGP40121 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPGP40121 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPGP40121 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPGP40121 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPGP40121 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms