Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXD13P35453 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXD13P35453 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD13P35453 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD13P35453 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD13P35453 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD13P35453 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD13P35453 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD13P35453 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD13P35453 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXD13P35453 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXD13P35453 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD13P35453 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD13P35453 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms