Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB4P30926 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB4P30926 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB4P30926 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB4P30926 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms