Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP1P29762 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP1P29762 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRABP1P29762 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRABP1P29762 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms