Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
HMGB2P26583 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
HMGB2P26583 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HMGB2P26583 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HMGB2P26583 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms