Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A2P23975 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A2P23975 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A2P23975 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms