Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCN2P20062 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCN2P20062 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCN2P20062 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCN2P20062 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCN2P20062 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCN2P20062 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCN2P20062 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCN2P20062 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN2P20062 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN2P20062 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN2P20062 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN2P20062 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN2P20062 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCN2P20062 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCN2P20062 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCN2P20062 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCN2P20062 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCN2P20062 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCN2P20062 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCN2P20062 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCN2P20062 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCN2P20062 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCN2P20062 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCN2P20062 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN2P20062 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN2P20062 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN2P20062 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN2P20062 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN2P20062 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCN2P20062 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCN2P20062 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCN2P20062 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCN2P20062 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCN2P20062 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCN2P20062 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCN2P20062 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCN2P20062 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCN2P20062 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCN2P20062 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCN2P20062 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCN2P20062 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCN2P20062 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCN2P20062 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCN2P20062 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCN2P20062 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCN2P20062 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCN2P20062 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCN2P20062 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCN2P20062 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCN2P20062 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCN2P20062 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCN2P20062 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCN2P20062 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCN2P20062 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCN2P20062 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCN2P20062 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCN2P20062 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCN2P20062 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCN2P20062 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCN2P20062 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCN2P20062 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCN2P20062 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCN2P20062 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCN2P20062 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCN2P20062 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCN2P20062 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCN2P20062 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCN2P20062 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCN2P20062 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCN2P20062 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCN2P20062 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCN2P20062 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCN2P20062 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCN2P20062 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCN2P20062 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TCN2P20062 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCN2P20062 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCN2P20062 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCN2P20062 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCN2P20062 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCN2P20062 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCN2P20062 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCN2P20062 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCN2P20062 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TCN2P20062 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCN2P20062 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCN2P20062 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCN2P20062 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCN2P20062 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCN2P20062 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCN2P20062 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCN2P20062 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCN2P20062 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCN2P20062 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCN2P20062 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCN2P20062 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCN2P20062 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCN2P20062 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TCN2P20062 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms