Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CD58P19256 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CD58P19256 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CD58P19256 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CD58P19256 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CD58P19256 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CD58P19256 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CD58P19256 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CD58P19256 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CD58P19256 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD58P19256 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CD58P19256 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD58P19256 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CD58P19256 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CD58P19256 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CD58P19256 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD58P19256 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD58P19256 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD58P19256 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD58P19256 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD58P19256 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD58P19256 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD58P19256 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD58P19256 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD58P19256 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD58P19256 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD58P19256 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD58P19256 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD58P19256 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD58P19256 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CD58P19256 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD58P19256 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD58P19256 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD58P19256 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD58P19256 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD58P19256 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD58P19256 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD58P19256 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD58P19256 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD58P19256 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD58P19256 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD58P19256 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD58P19256 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD58P19256 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD58P19256 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD58P19256 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD58P19256 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD58P19256 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD58P19256 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD58P19256 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD58P19256 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CD58P19256 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD58P19256 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD58P19256 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD58P19256 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD58P19256 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD58P19256 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD58P19256 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CD58P19256 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD58P19256 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD58P19256 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD58P19256 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD58P19256 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD58P19256 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD58P19256 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD58P19256 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD58P19256 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD58P19256 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD58P19256 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD58P19256 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD58P19256 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD58P19256 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CD58P19256 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD58P19256 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD58P19256 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD58P19256 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CD58P19256 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD58P19256 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD58P19256 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD58P19256 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CD58P19256 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CD58P19256 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CD58P19256 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD58P19256 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD58P19256 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD58P19256 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD58P19256 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD58P19256 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD58P19256 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD58P19256 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD58P19256 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD58P19256 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD58P19256 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD58P19256 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD58P19256 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD58P19256 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD58P19256 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD58P19256 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD58P19256 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD58P19256 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms