Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGAM1P18669 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGAM1P18669 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGAM1P18669 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PGAM1P18669 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGAM1P18669 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAM1P18669 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAM1P18669 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAM1P18669 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAM1P18669 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGAM1P18669 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGAM1P18669 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms