Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF30P17039 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF30P17039 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF30P17039 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF30P17039 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF30P17039 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF30P17039 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms