Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HKR1P10072 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HKR1P10072 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HKR1P10072 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HKR1P10072 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HKR1P10072 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HKR1P10072 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HKR1P10072 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HKR1P10072 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HKR1P10072 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HKR1P10072 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HKR1P10072 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HKR1P10072 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HKR1P10072 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HKR1P10072 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HKR1P10072 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HKR1P10072 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HKR1P10072 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HKR1P10072 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HKR1P10072 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HKR1P10072 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HKR1P10072 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HKR1P10072 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HKR1P10072 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HKR1P10072 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HKR1P10072 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HKR1P10072 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HKR1P10072 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HKR1P10072 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HKR1P10072 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HKR1P10072 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HKR1P10072 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HKR1P10072 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HKR1P10072 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HKR1P10072 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HKR1P10072 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HKR1P10072 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HKR1P10072 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HKR1P10072 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HKR1P10072 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HKR1P10072 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HKR1P10072 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HKR1P10072 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HKR1P10072 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HKR1P10072 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HKR1P10072 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HKR1P10072 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HKR1P10072 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HKR1P10072 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HKR1P10072 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HKR1P10072 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HKR1P10072 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HKR1P10072 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HKR1P10072 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HKR1P10072 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HKR1P10072 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HKR1P10072 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HKR1P10072 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HKR1P10072 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HKR1P10072 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HKR1P10072 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HKR1P10072 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HKR1P10072 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HKR1P10072 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HKR1P10072 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HKR1P10072 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HKR1P10072 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HKR1P10072 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HKR1P10072 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HKR1P10072 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HKR1P10072 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HKR1P10072 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HKR1P10072 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HKR1P10072 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HKR1P10072 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HKR1P10072 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HKR1P10072 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HKR1P10072 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HKR1P10072 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HKR1P10072 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HKR1P10072 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HKR1P10072 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HKR1P10072 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HKR1P10072 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HKR1P10072 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HKR1P10072 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HKR1P10072 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HKR1P10072 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HKR1P10072 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HKR1P10072 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HKR1P10072 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HKR1P10072 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HKR1P10072 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HKR1P10072 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HKR1P10072 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HKR1P10072 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HKR1P10072 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HKR1P10072 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HKR1P10072 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HKR1P10072 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms