Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC172P0C7W6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC172P0C7W6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC172P0C7W6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms