Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOCP08134 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOCP08134 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOCP08134 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOCP08134 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOCP08134 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOCP08134 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOCP08134 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOCP08134 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOCP08134 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOCP08134 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOCP08134 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOCP08134 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOCP08134 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOCP08134 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOCP08134 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOCP08134 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOCP08134 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOCP08134 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOCP08134 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOCP08134 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOCP08134 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOCP08134 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOCP08134 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOCP08134 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOCP08134 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOCP08134 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOCP08134 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOCP08134 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOCP08134 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOCP08134 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOCP08134 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOCP08134 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOCP08134 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOCP08134 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOCP08134 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOCP08134 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOCP08134 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOCP08134 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOCP08134 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOCP08134 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOCP08134 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOCP08134 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOCP08134 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOCP08134 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOCP08134 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOCP08134 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOCP08134 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOCP08134 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOCP08134 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOCP08134 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOCP08134 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOCP08134 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOCP08134 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOCP08134 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOCP08134 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOCP08134 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOCP08134 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOCP08134 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOCP08134 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOCP08134 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOCP08134 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOCP08134 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOCP08134 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOCP08134 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOCP08134 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHOCP08134 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHOCP08134 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOCP08134 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOCP08134 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOCP08134 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOCP08134 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOCP08134 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOCP08134 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOCP08134 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOCP08134 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOCP08134 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOCP08134 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOCP08134 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOCP08134 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOCP08134 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOCP08134 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOCP08134 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOCP08134 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOCP08134 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOCP08134 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOCP08134 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOCP08134 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOCP08134 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOCP08134 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOCP08134 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RHOCP08134 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOCP08134 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOCP08134 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOCP08134 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOCP08134 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOCP08134 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOCP08134 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOCP08134 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOCP08134 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms