Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TUBB4AP04350 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB4AP04350 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB4AP04350 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB4AP04350 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB4AP04350 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB4AP04350 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TUBB4AP04350 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB4AP04350 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB4AP04350 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB4AP04350 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB4AP04350 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB4AP04350 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB4AP04350 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBB4AP04350 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBB4AP04350 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBB4AP04350 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBB4AP04350 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4AP04350 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms